Na przełomie września i października w Górach Stołowych obserwujemy zjawisko inwersji termicznej. Polega ono na odwróceniu układu temperatur – wraz ze wzrostem wysokości wzrasta temperatura powietrza. Inwersji towarzyszy zwykle tak zwane „morze mgieł” – kiedy zimne, wilgotne powietrze zalega w dolinach, zaś ciepłe, suche unosi się wyżej.

Jesienią liście na drzewach i krzewach zmieniają kolor. Jest to wynik zahamowania procesu fotosyntezy i zaniku zielonego barwnika (chlorofilu). Drzewa rozpoczynają produkcję karotenoidów, odpowiadających za zmianę koloru liści na żółty i pomarańczowy oraz antocyjanidów, które nadają liściom kolor czerwony.

Trwa rykowisko, czyli okres godowy jeleni szlachetnych. W tym czasie samce nawołują samice wydając niskie, basowe odgłosy. Takie nawoływania rozpoczynają wieczorem, a kończą nawet przed świtem. Czas rykowiska trwa zwykle do czterech tygodni.